Научные исследования Емелина В.А. направлены на изучение процессов трансформации идентичности личности в условиях развития технологий информационного общества, выявление механизмов адаптации к информационным технологиям, социально-психологических аспектов технологий виртуальной реальности и симуляции. Особый интерес представляет исследование влияния социокультурных и технологических трансформаций изменяющегося хронотопа информационного общества на современного человека, а также вопросы улучшения взаимодействия человека с техническими средствами.
Основные научные идеи отражены в монографии «Идентичность в информационном обществе», издание которой было поддержано фондом РФФИ, проект 17-06-16023 Д, а также в находящейся в печати монографии «Идентичность и символический хронотоп» (в соавторстве с Тхостовым А.Ш.), издание которой было поддержано фондом РФФИ, проект 20-113-00049 Д.
Руководитель 5 грантовых исследовательских проектов: «Когнитивно-личностные факторы радикалистских установок и форм поведения», РФФИ №18-013-01222а (2018 г. – н.в.); «Трансформация высших психических функций в условиях развития информационного общества (культурно-исторический подход)», РГНФ №14-06-00730а (2014–2016 гг.); «Механизмы психологической адаптации человека к технологическим изменениям в современном информационном обществе», РГНФ №11-06-00733а (2011–2013 гг.); «Психологические и социокультурные аспекты влияния информационных технологий на формирование и нарушение самоидентификации», РФФИ 10-06-00543а (2010–2012 гг.). Участвовал в более 20 грантовых и научно-исследовательских проектах.
Разработанные методики и полученные результаты в ходе выполнения исследовательских проектов были обобщены в учебно-методическом пособии «Диагностика психологических последствий влияния информационных технологий на человека» (в соавторстве с Е.И. Рассказовой и А.Ш. Тхостовым).
Разработал рабочую программу учебной дисциплины «Социокультурные и клинико-психологические аспекты информационных и коммуникационных психологий» для студентов факультета психологии МГУ.
Трижды удостаивался Премии победителя Конкурса работ, способствующих решению задач Программы развития Московского университета в номинации "Выдающиеся публикации" в 2019 г., в 2018 г. и в 2017 г.